Le positionnement du CBMO a été établi en fonction des infrastructures existantes de la ville comme la station de traitement des eaux usées est (STEU) et l'incinérateur de la ville de Québec. Le bâtiment intègre le centre de biométhanisation, des espaces administratifs, des laboratoires ainsi qu'une salle d'interprétation multifonctionnelle. L’usine permettra de traiter jusqu’à 86 600 tonnes/an de résidus alimentaires et 96 000 tonnes/an de biosolides provenant de la station d'épuration des eaux usées.
Le bâtiment présente une volumétrie articulée et un secteur ouvert sur l’espace public représentant l’orientation de la ville de Québec visant la démocratisation et la vulgarisation du procédé de biométhanisation. Le langage architectural entre en dialogue avec son environnement et contribue à rompre avec les préceptes d’une architecture industrielle usuellement terne et opaque.